Başyazarlığını, UNAM Proje Yürütücülerinden Öğr. Üyesi Dr. Aykut Erbaş’ın gerçekleştirdiği, UNAM MSN doktora öğrencisi Zafer Koşar ile UNAM MSN yüksek lisans öğrencisi A. Göktuĝ Attar’ın da ortak yazar olarak yer aldıkları “Bakteri Hapsedilmesinde Protein-DNA Ayrışma Kinetiğinin Çözülmesi” başlıklı çalışma Biophysical Journal’ın kapağından yayınlandı.
DNA’lar yaşamı genler aracılığıyla kodlarken, gen ekspresyonu, öncelikle bir dizi protein ve transkripsiyon faktörleri (TF’ler) tarafından transkripsiyon seviyesinde kontrol edilmektedir. TF’lerin düzenleme mekanizması, geçici DNA-TF etkileşimlerine bağlıdır. Aktive edici veya baskıcı TF’ler, DNA’daki spesifik bölgelerini bağladıktan sonra geni “açık” ve “kapalı” durumlar arasında değişmektedirler. Bu geçici etkileşimin ömrü, transkripsiyon oranları üzerinde önemli bir etkiye sahiptir. Bu çalışmada, TF’lerin DNA’da kalma sürelerini hangi faktörlerin kontrol ettiğini moleküler bir dinamik model ile ele alınmaktadır.
